故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，因意外一名外星人从宇宙坠落。失去过往记忆的外星人“奥美迦”化身为地球人模样，被人称为“宙人”。他对人类充满好奇，积极地接触这些陌生的生命体。当神秘巨型生物接连出现时，尘封的记忆碎片被唤醒，宙人脱口而出“怪兽”二字。面对怪兽的威胁，强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼，与怪兽作战。随着故事推进，来自外星的宙人与一位普通青年逐渐成为并肩作战的伙伴。
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波特比是一种机械生物，就像电子宠物一样。它能吃，能睡，会玩，甚至可以帮主人干活。刚升上国一的花小金井云雀从常出现在她梦里的王子葛林邦席泰克那里，得到了一只名为传助的波特比。一群神秘的人试图抢夺传助，云雀惊奇的发现，传助竟变身成强有力的电子斗士击退了敌人。云雀的朋友也收到了同样的波特比。她们一起，组成了——秋叶原电脑组。
因为工作需要而潜入魔宫的冒险家‧阿始，遇见了肚子饿的少女‧莉露。不忍心丢下遭到父母亲抛弃，无依无靠的她——…「如果你想当我的同伴，那就别再哭了！」于是他们两人开始一起生活。但是莉露她并不是「单纯的」少女……？
